各大城市都有到温州的班机和列车，可跟当地的航运部门联系.各大中城市基本每天都有到温州及温州周边集镇的大巴卧铺班车。 
上海——鳌江大巴车（沃尔沃或尼奥普兰） 
票价：150-180元 
班次：每天三班以上 
始发车站：太平洋客运站（上海火车站，龙门宾馆过高架桥） 
上海始发时间：13：00，19：30，18：30（公平码头，丹涂路） 
路上时间：7小时左右 
订票电话：13901747013（上海），13868509876（鳌江） 
北京——鳌江大巴（凯斯鲍尔或奔驰） 
票价：350元左右 
班次：每天一班 
始发车站：沙子口（京温大酒店） 
北京始发时间：12：00 
路上时间：20小时左右 
订票电话：13501387553，010-67231407（北京），13958900888（鳌江） 
去南麂的船，情况是这样的：温州、瑞安、敖江都有快艇或普通船至南麂。 
温州至南麂的快艇只在旅游旺季（5/6/7/8月）开，票价120元/人，团队可打折 
上船地点：温州的安澜亭码头 
开航时间：7：30 
联系电话：0577-88190773（海运旅行社） 
瑞安至南麂的快艇飞云一号，票价90元/人，团队可打折 
上船地点：瑞安港沿海码头 
开航时间：当天候潮 
联系电话：0577-65613916,65891305，65622468 
由于南麂在行政上和敖江同属于平阳县，因此敖江至南麂的船最多，快艇和交通船都有。一天有数班。每年4月30日－10月10日，快艇88元/人，普通船35元/人，其余时间快艇50元/人，普通船30元/人。快艇上岛需要1小时10分钟，普通船2.5小时，较颠簸，需备药物，快艇上会分发塑料袋。快艇的额定乘客99人，在旅游旺季，上岛的人较多，一定要提前预订，也可通过岛上预订的宾馆来预订来回船票。 
上船地点：鳌江镇第四码头（南麂客轮码头） 
敖江港电话：0577-63653991传真：0577-63651993 
开航时间：当天候潮。 
岛内的交通： 
岛上的交通主要靠中巴。南麂新码头到大沙澳5元/人，新码头到三盘尾10元/人。船一靠岸，就有各宾馆的车在岸上等，如果你预定了宾馆，你只管上预订好的宾馆的车就是。宾馆的中巴，统一价30/人，包括宾馆至码头之间，宾馆至沙滩，宾馆－三盘尾来回费用，不另收费。当然，你也可以在码头那里联系好船家，去你想去的那个岛，具体价格可以和当地渔民商量，价格在300-400元/船，包一天。去你想去的地方，也有在那里叫客人的船，10元/人，去鸟岛或是大擂山水仙花岛的，不过不多见。还有就是可沿环海公路（在整修当中）徒步到达大沙澳。 
离南麂岛最近的陆上口岸是平阳县的鳌江镇。温州牛山北路客运中心至鳌江有快客（车内有空调彩电，约15分钟一趟）票价17元/人）。 
水路交通 
鳌江至南麂，高速船工作日旺季每天4班，行船时间70分钟的票价88元/人，行船时间90分钟的票价70元，交通船每天2班，行船时间150分钟的35元/人，行船时间165分钟的票价30元/人。双休日增加航班。 
船靠鳌江第4码头，电话：0577-63653991。 
瑞安至南麂，高速船每天2班，8：00和 13：30开船，船靠瑞安港南门客运码头，电话：0577-65638525，票价：90元，团体价优惠。 
温州至南麂岛的快速船在夏季（7-9月）周五周六周日三天才会开，船靠温州望江码头。温州7：00开，南麂13：30返，2.5小时航程，票价120。 
旺季时船票相对紧张，可通过岛上宾馆代购回程船票。 
岛上交通 
出租车：岛上各景点间无班车，可搭宾馆的中巴或包出租车（桑塔纳），只需告诉宾馆你要去的景点。在岛上的交通费约30元。